1、染色体异常：染色体异常是触发囊胚质量低下的常见原因之一。
如果囊胚染色体异常，它们很可能无法正常着床并发育。解决方法：通过基因筛查或PGS来筛查携带染色体异常的囊胚，以选择质量更好的囊胚进行移植。2、胚胎发育问题：囊胚在培养过程中可能出现发育问题，造成其质量下降。这可能是受制于培养环境不理想或其他因素引起的。解决方法：改善培养环境，确保囊胚能够在较好条件下发育。3、冰冻和解冻问题：如果囊胚在冷冻和解冻过程中受到损伤，其质量可能会下降。解决方法：采用先进的冷冻和解冻技术，最大限度地减少对囊胚质量的影响。
子宫内膜是囊胚着床所需的理想环境。如果子宫内膜存在问题，如厚度不足或不适合着床等情况，移植过程中就有可能失败。1、子宫内膜厚度不足：子宫内膜厚度不足可能衍生出囊胚无法成功着床。解决方法：通过使用荷尔蒙疗法来增加子宫内膜的厚度，以提高囊胚着床的成功率。2、不适合着床的子宫内膜：有时候，子宫内膜可能存在其他问题，如异位内膜或息肉等，这些都可能影响囊胚的着床。解决方法：在移植前进行详细的子宫检查，确保子宫内膜适合囊胚着床。
免疫系统异常也是衍生出试管三代移植六天的囊胚失败的一个重要因素。